熊丙奇直言，大學的課堂教育建設存在著非常嚴重的問題，而問題的根源就在于大學沒有辦學自主權。很多學校的課程設置必修科目太多，選修科目過少。有相當多的課程，學生不愿意上，老師也覺得這個課對學生的價值意義不大。但是學生需要通過這個必修課，拿到學分，才能畢業(yè)，所以他必須去上。他認為，“很多學校開設的類型科目，甚至學校自己本身都不愿意開設，但是按照有些規(guī)定必須開，結果開設了以后，教課老師在應付，學生對此也不會太感興趣�！�
同時他表示，點名只是一個表象。深層原因是學校忽視人才培養(yǎng)的導向、社會重視學歷而輕能力等導向問題�！皩W校以學術研究為評價體系，導致教師以研究為主，不重視學生在課堂的學習。而對于社會，以文憑來評價人才，而不是以能力來評價人才，讓很多學生有了‘混’一張文憑的想法”。
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